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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

经常最为矿业制造原材料而被熟知 世界的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“消化吸收废料”成為“宝物小分子式”的心路艰辛艰辛相似性,到近几十年才被发展其注重的生物工程学功能模块,从此之后“平躺农奴把唱歌”,特别的是在免疫抗体发炎病变性问题理论研究行业领域内异军突起。至今几篇综述有关资料了在多种多样发炎病变性问题的哺乳动物模式中争取衣康酸或其有机化学体现研究物工程的开展益处,连接数展其意向靶点。并于衣康酸的“上辈子”与“今世”,详情推书《乳酸的实现逆袭哥俩——衣康酸!选文兜兜风熟知 衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化体现蛋白酶组学产品,实现1000+高妙度修饰语位点检测出,安全再次出现传统靶点,全地方生信介绍解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“出现”到“认证”全流量贴心服务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、实验操作环节

02、测试统计资料

03、经“点”再次出现

在实际数据统计中,查出若干专著中新闻稿的精典靶点以至于衣康酸掩盖位点,如首个被挖掘的衣康酸共价掩盖球淀粉酶KEAP1,还要糖酵解通道中的3个主要酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,及炎性小体构造球淀粉酶NLRP3和受损细胞萎缩方式中的主要球淀粉酶RIPK3等,其质谱图相应图提示。

04、车辆结构特征

1.多方面质控

服务业化活性聊天电极孵育、SDS-PAGE探测、WB核验、样例相应的性定量分析等各种位探测,为了保证工作导致质量性。

2.高机械性能质谱医疗仪器网络平台

在Orbitrap Astral全新一批高判别质谱仪带动下,控制衣康碱化表达位点及蛋白质签别新程度,助推器科学的的研究新会发现。

3.全流程图一走式功能

依托于拜谱动物建全的科学实验app,可保证“细胞膜培训→探头孵育→WB判断→玄之又玄度衣康酸性反应突显判断→特权生信阐述→特殊位点PRM检验”全操作流程安全服务,省时省钱更高效。

05、深入分析介绍(有些)

06、使用方位

PART 2、文献综述转发

论文资料一

英文怎么说一级标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

英文版问题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

学习文章:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

文章二

英文音标问题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

汉语关键词:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

科学研究方面:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、典例并衍生想法

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13体现了比较强的底物搭配能力素质,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物技术衣康酸性反应呈现组测试资料中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应遮盖(以下图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱总结

用于TCA循环往复中的两边分泌转化物,衣康酸可以调节分泌转化、抗体检测细胞和病毒两者的互不效果,为制疗抗体检测细胞病毒性病毒保证了代替制疗措施。衣康酸构造中的亲电性α,β-不过剩羧酸构造能对核苷酸质上的灵活性半胱氨酸残基做出烷基化表达(迈克尔暴击伤害现象),这一项翻译工作后表达被被视为“衣康酸表达(itaconation)”,于是关系核苷酸质能力,宏观调控抗体检测细胞回复和分泌转化经过,为好几种病毒药品研发团队保证新思绪。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸体现蛋白质组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医学研究任何时候参考值靶向疗法基础代谢组(QMT1000)或养分分解靶向药物分解组產品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

关联性文献综述

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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