N6-甲基腺苷（m6A）是真核生态学mRNA中最猛要的转录后表达，在真核生态学的方面的问题和身理进程中起着至关必要的用。心脏病群体行为问题是一种种不可逆转的运动神经中枢运动神经操作系统退行性症状，现如今壮大真的切考核机制还没有仍然体现了，以及不足可以有效的以防和制疗的方法。

2024年2月6日，北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱生态学为其提供m6A甲基化进行分析能力服务项目，为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。

文章内容名稱：Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice（Int J Mol Sci.，IF=6.2，2024.2）

老客户厂家：北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院

科学研究用料：小鼠脑组织

拜谱保证能力：m6A甲基化（MeRIP-seq）

论文摘要图：

图1| 提要图(图源：Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)

研究方案可是

1.DCI小鼠海马中m6A遗传基因遮盖的转换

研发职工先是加入了高脂食物和认识程度思维障碍（DCI）的小鼠类别。为相当比组(n = 3)和DCI组(n = 3)之前的m6A表观遗传修饰语，研发职工用MeRIP-seq确定了转录组区间内的m6A-seq概述。在DCI组的10664个商品编号表观遗传转录物(mRNAs)中国国民党发现比组的237113个不重合的m6A峰。对比一下，DCI组呈现出23,7513个非重合m6A峰。在当中，9343个甲基化表观遗传在比组和DCI组之前重合(图2)。

图2| 照表组和DCl组m6a掩盖染色体的维恩图

共技术鉴定出127九个不相同甲基化的m6A位点(DMMSs)，里面60.88%(778/1278)和39.12%(500/1278)的甲基化程度分别是更为明显性超出剖析组。定量分析其遍布原因会发现m6A峰遍布在一小部分RNA中(图3A)，并结合其遍布的转录区城可分以内五组：5'UTR、3'UTR、转录起点位点区城电影片断、暂停账号支付管理员密码子电影片断、起点账号支付管理员密码子电影片断和简码编码序列(CDS)。m6A峰的在3'UTR、CDS和暂停账号支付管理员密码子随近更为明显性生物富集(图3B)。成了考核这样的DNA遗传上m6A呈现的区城，学习员工挑选了有峰注脚的区城，并校正了这样的DNA遗传上reads的涉及率。在DCI组中，m6A呈现区倾向于3'UTR区(图3C)。全部的mRNA内的DMMS都被追踪定位到脱色体往上面考核其遍布情况。不相同小鼠脱色体的m6A呈现谱不相同。

图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的变换

为检定m6A表达在DCI小鼠中的微生物制品学的功能，理论研究人从几组数中择包含有DMMS的球营养物质识别码DNA做GO和KEGG剖析(图4A)。在GO剖析中，高甲基化DNA在生殖组织阶段中 、微生物制品阶段中 管控、促使灵化学活化和杂环单质融入中对应性丰度。KEGG环路剖析体现 信息，高甲基化DNA与T生殖组织感觉4g表现环路、小生殖组织1.肺癌和RIG-I样感觉4g表现环路对应(图4B)。谈谈低甲基化DNA，GO剖析体现 信息在生殖组织阶段中 、分解阶段中 和融入阶段中 中对应性丰度有机化学环单质、融入杂环单质和促使灵化学活化(图4C)。KEGG环路剖析折射出了低甲基化DNA与肥厚性心肌病和Hippo4g表现环路的绑定qq(图4D)。

图4| 距离甲基化m6A位点的环路聚集

2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq信息的联席进行分析

很快调查工作员将m6A MeRIP-Seq的的数据文件和原本RNA-Seq的的数据文件来联席解析，得知163个mRNA，m6A峰和mRNA平行面正相关转变。41种mRNA的m6A和mRNA平行面调涨，14种mRNA平行面降低。虽然，30个染色体mRNA理解调涨，m6A平行面降低，7七个染色体mRNA理解降低，m6A平行面调涨(图5A)。另外，引入了一大个PPI系统来凸显163个染色体代码的蛋清间的连结(图5B)。

长为6如下图所示，GO和KEGG探讨涵盖四组：(1) m6A上涨，mRNA下跌；(2) m6A上涨，mRNA上涨；(3) m6A下跌，mRNA下跌；(4) 染色体m6A下跌和mRNA上涨。在GO探讨中，m6A上涨和mRNA下跌的染色体在感觉神经人体人体细胞系分解分泌的步骤、清香族化学物质怪物生成的步骤和RNA分解分泌的步骤的调节管控中有效生物丰度。KEGG探讨提示 ，这样的染色体在脂质酸分解分泌、小感觉神经人体人体细胞系肺腺癌、丙酸分解分泌和甲苯酸分解分泌中生物丰度。在m6A上涨和mRNA上涨的染色体，GO探讨提示 在亚铁构建、亚胺丙氨酸脱羧酶特异性、天冬氨酸1-脱羧酶特异性和感觉神经人体人体细胞系接装设负调节管控中生物丰度；KEGG探讨提示 在2型血糖高、脂质感觉神经人体人体细胞系因素讯号径路和胰岛素讯号径路中生物丰度。在GO探讨中，m6A下跌和mRNA下跌的染色体在寡肽构建、谷胱甘肽构建和二硫硫化物硫化还原故宫场景酶特异性中生物丰度，而在KEGG探讨中，这些食品在柠檬片酸重复往复(TCA重复往复)、丙酸分解分泌和多外来物种凋亡中生物丰度。在GO探讨中，m6A下跌和mRNA上涨的染色体在胚胎骨骨节基本特征突发、核蛋白激酶特异性重置和NADP分解分泌的步骤中生物丰度，在KEGG探讨中，m6A下跌和mRNA上涨染色体在新霉素、卡那霉素和感觉神经美味因素讯号径路中生物丰度。

图5| m6A甲基化与mRNA把你想表达出来的结合分折

图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG阐述

拜谱菌物总结

本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变，特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解，可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱生态学提供了m6A甲基化水平服务管理，拜谱生物工程可提供完善成熟的蛋清组学、新陈代谢组学、转录组学及几组学连合产品设备技术应用售后服务，欢迎致电咨询！

选取医学文献：Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.