代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
组成组成签定：分泌组学新技木性都可能对药才中的化学工业上的组成组成通过着力数据分析，签定出药才中的几丁质酶酶类组成组成。如，利于系统设计质谱（MS）的分泌组学新技木性，可能签定出长白山山参中的长白山山参皂苷等几丁质酶酶类组成组成。一种新技木性还可能判断中药才和非中药才位置的化学工业上的符号物，为药才的高质量把控好作为法律规定。
产品抑制：实施分解新陈消化吸收组学技木，需要对中成药的产品实施评价指标和抑制。举例子，充分利用藤本树种分解新陈消化吸收组学介绍，需要发展争对类痛风性骨节炎的中成药部分的产品符号的降钙素原检测最简单的方法。于此，分解新陈消化吸收组学还需要掌握中成药中的毒副作用部分还有其毒副作用原则，如实施UPLC-Q-TOF-MS设计，界定不一样的乌头藤本树种的化学工业部分，并掌握有着止痛灵活性和急慢性毒副作用的海洋生物碱。
2. 中药药效机制研究
意义靶点辨别：分泌组学技术应用也可以帮到辨别中葯活力性营养成分的氧分子靶点。举列，调查表明雷公藤红素可根据改善Treg/TH1和Treg/Th17静态平衡、恰恰能阻隔NF-κB信号通路等原则发挥用免疫抑制意义。
反应机理阐明：排泄组学技術就能够折射出中药方方医疗慢性病的反应机理。这类，科学理论研究得知青蒿素抗药与疟原虫的线粒体排泄发生变幻有关的，非靶向药物排泄组学折射出了与该的过程 有关系的排泄物变幻。因此，排泄组学还行使用阐述排泄物的变幻，科学理论研究中药方方复方的反应机理。
3. 中药安全性评价
致癌性制度化探析：分解组学技能会使用在探析药材的致癌性制度化。假如，经过分解组学和16S rDNA测序的整理了解，具体分析了清益汤对危重急慢性胰腺炎相关急慢性肺损害的保养制度化，并判定了铁镇定自若、的差异分解物和微菌物菌群之中的内在联系。
安全防护保障保障性考评：分解组学新技术还就可以于中药配方材的安全防护保障保障性考评，甄别潜在性的的致毒组分和致毒靶点，关键在于为中药配方材的安全防护保障保障食用供应科学技术数据。
4. 中医证候研究
证候关于分解物分折：分解组学科技就能够应用在表现与中国传统医学证候关于的内源性分解物变幻，辅助软件中国传统医学证候的临床诊断和预防。比如，实现分解组学研究探讨，已在冠相思病的人中认定出与痰瘀证随和阴两虚证关于的生态学因素物。
证候介入科研：分泌转化组学枝术性还能在科研中药材对中医医生证候的介入结果。这类，利用分泌转化组学枝术性及聚类数据分析数据分析法，挖掘“黄芪-茯苓-泽泻”等一些联中药选用适在肾病总体征的新组方中药，要对多肾病总体征一些的怪物象征物形成影晌。
5. 多组学技术整合应用
多个学兼容合并：新陈代谢组学与其它组学技术工艺（如基因遗传组学、转录组学、蛋清质组学等）的兼容合并选用，为草药才科学研究打造一个多层次的阐述框架结构。各种兼容合并选用不但显现了自己对草药才化学成分在碳原子层级上对人体健康生活和病症睡眠状态的会影响，而为探求草药才的的功效策略和药性杂质基础条件打造了强重要的道具。
肠道患病诊疗制度化：几组学技术利用是可以适用科学研究中药配方诊疗肠道患病的氧分子制度化。这类，用蛋清质组学和分泌组学的协力利用，反映了与中医理论分类别的膝软骨骨性软骨炎密不可分相关的不同理解蛋清和分泌信号通路。
分解组学系统在草药论述中的应运，为草药的新近代化和正确诊疗作为了核心的小学科学兼容，利于驱动草药的规范化和国际上化发展前景。