
2024年9月由成都农牧业大专张万刚教导团对在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物体为该研究提供了亚硝基化装饰组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文翻译宝贝标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
刊物:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202几年后果系数:5.7
提出日期:2024年9月
用户工作单位:南京农业大学
分析的原材料:蛋白
拜谱提供了枝术:亚硝基化修饰组学
技巧路线地图:
一、的研究結果
01.Caspase-3活性酶类
近些年尚不知道NO对caspase-3的阻止反应可不可以归因于NO介导的S-亚硝基化,有差异密度梯度方向的GSNO做外源性NO厂家直销,以诱骗caspase-3的身体外S-亚硝基化。最终结果揭示,与并没有GSNO的组相对比,100、200和400μM GSNO组的caspase-3生物更为明显降了(图1),与原先新闻稿完全一致。GSNO处里降了caspase-3生物的内在的问题仍仍待揭示。
图1 有所不同氨水浓度的GSNO办理对caspase-3特异性的影晌
02.Caspase-3的S-亚硝基化成度
设计Caspase-3的亚硝基化的情况,以揭示GSNO对Caspase-3的进行反应性。经GSNO加工后,检则到caspase-3血清S-亚硝基化強度添加(图2)。等等毕竟取决于,外源性GSNO致力于可成功的 成脂caspase-3的身体之外S-亚硝基化。真让人惊愕的是,在还没有GSNO具有的差表组中检则到某个微亮的S-亚硝基化带,这取决于caspase-3能够进行内源性的S-亚硝基化。于此,本设计中caspase-3的S-亚硝基化的情况较高,而caspase-3的生物缩减,这与先前的设计不符。但是,caspase-3的特异形S-亚硝基化绘制位点尚不看清楚,还所需进一大步的探求。
图2 GSNO进行处理对caspase-3S-亚硝基化级别的影响到
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化修饰语组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的回文字段。颜色标示图片的回文字段指出S-亚硝基化肽,网红标示图片的C指出S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱仪
04.S-亚硝基化Caspase-3挥发结核蛋白
结淀粉酶质酶用作一种生活最至关重要的受损体细胞骨架淀粉酶质酶,在保证肌受损体细胞成分的的成分的系统性和收宿性这方面起着最至关重要功用,实验S-亚硝基化caspase-3对结淀粉酶质酶分解的的敏理性极具最至关重要功用。与Std(未用胱天淀粉酶质酶酶-3和GSNO孵育的刚开始肌氯纶棉淀粉酶质酶)组相信,0 μM GSNO组(肌原氯纶棉和caspase-3的孵育,无GSNO)的系统结淀粉酶质酶硫占比更为很明显消减,显示caspase-3对结淀粉酶质酶极具不确定的淀粉酶质酶油脂水解学习能力。在GSNO孵育后,系统结淀粉酶质酶的硫占比很明显增多(P < 0.05)。不仅而且,当GSNO密度增高时,系统结淀粉酶质酶的硫占比持续性调整(P < 0.05)(图5)。一项看到取决于,SNO呈现的caspase-3以平行根据的策略压制结淀粉酶质酶的分解。
图5.S-亚硝基化caspase-3光降解结蛋白酶
05.S-亚硝基化Caspase- 3挥发肌钙血清-T
肌钙血清质-T (TnT)是原肌球血清质调准承担力量弯曲的细细的的需要肌原植物人造化学纤维血清质。TnT的可分解的特点是论文在线检测到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化的条件下,caspase-3对TnT的可分解问题如图甲如图6如图,与Std组(富含caspase-3和GSNO的肌原植物人造化学纤维)比起来,caspase-3组中30 kDa TnT场面偏态提升,意味着caspase-3凭借了TnT的可分解,前者,caspase-3与GSNO的孵育造成的30 kDa TnT越来越低。在100和200 μM GSNO组相互间不能论文在线检测到取得的的区别(P > 0.05),而当GSNO的含量达成400 μM 时,该场面偏态避免(P < 0.05)。这一些显示意味着了SNO绘制语的caspase-3对TnT可分解的促使用途。结血清质和TnT是caspase-3的过敏底物,而GSNO治理 缩减caspase-3的亲水性已经造成的肌原植物人造化学纤维血清质可分解成度缩减。综合上面的上述一系列的,NO诱惑的S-亚硝基化是可以凭借绘制语半胱氨酸残基来调准caspase-3的亲水性,必将进一歩不良决定其对结血清质和TnT的血清质溶解能力素质,然而不良决定牛羊肉品質。
图6. S-亚硝基化caspase- 3分解肌钙蛋白酶-T
二、总结ppt
本探究广泛宣传浅论S-亚硝基化对caspase-3突显语的的的影响极其那么对牛羊肉片肌原棉纤维素身体挥发的的的影响。蛋清S-亚硝基化能能突显语caspase-3的半胱氨酸残基,因而形成caspase-3灵活性大大减少,进的一步可抑制了其对牛羊肉片肌原棉纤维素蛋清的蛋清水解反应的能力。三、拜谱总结ppt
研发按照了酶活法测定,亚硝基化装饰组学解析,WB等检验途径,会发现球淀粉酶酶S-亚硝基化可不可以装饰caspase-3的半胱氨酸残基,这出现了caspase-3可溶性的影响,相结第一步控制了其对羊肉肌原化学纤维球淀粉酶酶的球淀粉酶酶水解反应力。本研发为描述球淀粉酶酶质亚硝基化对口感的自我调节策略带来了好几个个新的视野。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的核营养素组学、绘制核营养素组学、代谢率组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸类型新产品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺硝化作用、total空气氧化完美重现、分离巯基,欢迎大家咨询!
参照期刊论文:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663