
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物体 为其提供 TMT血清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
实验没想到
调查人数洞察分析一下伴随冷冻事件加长鸡肉的硬性、持水力发电、光色、阳极氧化钙平均水平铁平均水平、ROS、脂质过阳极非金属氧化物、MDA、GSH和GPX4平均水平来评估方法背部肌肉安排神经元的铁死情况。結果信息显示,冷冻事件加长后,鸡肉的硬性在第四天和第6天有明显减少;持水力降;色变深,失光滑,鲜鲜红颜色换为暗鲜红颜色。最后,阳极氧化钙平均水平铁、活力性氧和MDA的平均水平有明显加大,神经元凋亡率有明显增高。 研究概述工作人员取出各不相同冰箱耗时的腿部肌群样本的淀粉酶质,第二步实施SDS-PAGE概述,淀粉酶质条带在各不相同時期分布点平均且形似性(图1a)。通过淀粉酶在各不相同样本中的体现前提,概述挖掘同种条组样本的中数字取决于于同种条水平面(图1b),说腿部肌群样本淀粉酶质极具积极的组内形似性性和组间差别的性。 球高核血清组学共检测出1996种球高核血清。以B0为差表组,挑选B1、B2、B4和B6中的球核血清开始相互影响抒发分折,共检测到37七个DEPs。将火山图大数据可视化,并按照其FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两种标准化分折DEP。效果图甲1c-f所提示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别检测出22、33、73和140个DEPs,中间分刘海别调整6、11、32和89个,变动16、22、41和53个。聚类分析方式分析了不一样的冷藏库阶段中,全身肩部肌肉安排中球高核血清的抒发,效果提示全身肩部肌肉球核血清抒发相互影响随着用时的推移储藏用时的加强而加强(图1g)。
图1| 区别冷冻箱精力的肌肉群样品管理蛋清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 的不同保温耗时的胸肌原材料差别的球蛋白剖析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁枯死蛋白质肽的PRM降钙素原检测分享(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 体系结构KEGG含有的差异传达血清的铁死亡者考核机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人心得体会
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物体提供了TMT按量核脂肪酸组学科技安全服務,拜谱生物技艺已研发部完整并建立联系了加强发育成熟的转录组学、核球蛋白组学、排泄组学甚至几组学联办软件科技安全服務体系建设,欢迎致电咨询!
考虑学术论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.